基于16S rRNA测序的海南坡鹿肠道菌群结构分析

摘要：

通过构建菌群16S rRNA基因克隆文库和进行系统发育分析,对采集自广州动物园健康成年海南坡鹿的16个粪便样品的菌群结构和多样性进行分析,结果表明海南坡鹿粪便菌群分属于18个菌门,其中厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)是核心菌门,分别占比50.49％和36.52％.海南坡鹿肠道菌群中丰度最高的前10个属分别为5-7N15丰度值为7.181％、普雷沃菌属(Prevotella,3.159％)、密螺旋体属(Treponema,2.788％)、琥珀酸弧菌属(Succinivibrio,2.545％)、颤螺菌属(Oscillospira,2.304％)、CF231丰度值1.843％、瘤胃球菌属(Ruminococcus,1.652％)、艾克曼菌属(Akkermansia,1.439％)、甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter,1.340％)、梭菌属(Clostridiu,1.333％).对比不同性别海南坡鹿(Cervus eldi hainanus)肠道菌群,通过t检验,统计出具有差异显著(P＜0.05)的属共17个.

关键词：海南坡鹿、肠道菌群、16S rRNA

所属期刊栏目：39

分类号：Q93(微生物学)

在线出版日期：2018-12-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：761-768