基于GEO芯片联合网络药理学探讨当归饮子治疗慢性荨麻疹的cross-talk及miRNA-mRNA机制

摘要：

目的 采用GEO芯片联合网络药理学的研究方法,初步探讨当归饮子治疗慢性荨麻疹(CU)的cross-talk及miRNA-mRNA机制,为后续实验研究提供理论基础.方法 采用R语言limma包对GSE57178芯片进行差异分析;采用TCMSP、TCMID、PubChem、String、DAVID、TargetScan数据库对当归饮子有效成分、潜在靶点、PPI、KEGG、cross-talk及miRNA-mRNA机制进行预测分析.结果 GSE57178差异分析得出257个差异基因,其中240个基因表达上调(如:HIF1A、MMP12、STAT3等);有17个基因表达下调(如:FABP7、KRT15、LGR5等),其中有36个当归饮子治疗慢性荨麻疹的潜在靶点,拓扑分析出24个关键靶点基因在其中发挥重要作用;cross-talk分析得出1个靶点(SELE)在TNF通路与细胞粘附分子(CAMs)2条通路中“串话”;1个靶点(ITGB2)在吞噬体与CAMs 2条通路中“串话”;2个靶点(CTSL、CTSS)在抗原处理表达、吞噬体与溶酶体3条通路中“串话”;2个靶点(VCAM1、ICAM1)在NF-kappa B、TNF与CAMs 3条通路中“串话”;1个靶点(TLR4)在HIF-1、NF-kappa B、吞噬体3条通路中“串话”;miRNA-mRNA预测分析得出24个潜在靶点mRNA,构成了477组miRNA-mRNA模式,在CU炎症反应中发挥作用.结论 本研究从基因、分子角度预测和分析了当归饮子治疗CU的多靶点、多cross-talk、多miRNA-mRNA作用机制,为后续研究提供了依据,可成为未来机制研究的新方向.

关键词：GEO、当归饮子、慢性荨麻疹、网络药理学、cross-talk、miRNA

所属期刊栏目：43

分类号：R285(中药学)

资助基金：“十三五”国家重点研发计划中医药现代化研究重点专项“针灸优势病种疗效评价国际合作研究”项目;国家中医药管理局湖湘五经配伍针推学术流派传承工作室项目;湖南省中医药管理局重点项目;国家重点基础研究发展计划973计划;湖南中医药大学中医学一流学科开放基金项目

在线出版日期：2020-12-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：79-86