猪捷申病毒云南流行株的遗传进化

摘要：

[目的]了解云南省猪场捷申病毒(porcine teschovirus,PTV)的感染情况及流行毒株分子进化特征,为预防控制该病提供参考.[方法]从云南曲靖、弥勒和大理的猪场随机采集粪便样品,采用RT-PCR方法对PTV 5′-UTR部分基因片段进行扩增、克隆及测序,通过生物信息学软件进行同源性分析并构建系统进化树.[结果]PTV核酸阳性率达 27.3%(32/117),测序后去除重复序列得到 6条序列.同源性分析结果显示:株间核苷酸同源性为 93.2%～98.9%,与参考序列核苷酸同源性为 89.7%～100.0%;系统进化树构建结果显示:YNDL-2和YNDL-3与四川省分离的PTV毒株亲缘关系较近;YNQJ-1与日本分离的PTV毒株亲缘关系较近;YNDL-1、YNQJ-4和YNQJ-5聚为一簇,与多米尼加分离的毒株亲缘关系较近,表明同一猪场存在不同血清型感染.[结论]云南猪场PTV感染率较高,流行株间进化关系差异较大,同一猪场存在不同基因型的病毒感染,未体现出明显的地域性.研究结果为PTV致病机理、疫苗研制及防控等奠定了基础.

关键词：猪捷申病毒、分子流行病学、同源性分析、遗传进化

所属期刊栏目：38

分类号：S852.651(动物医学（兽医学）)

资助基金：云南省科技厅重大科技专项计划202102AE090007

在线出版日期：2024-01-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：937-941