昭通牛mtDNA D-loop区遗传多样性分析

摘要：

[目的]阐明昭通牛群体遗传背景信息.[方法]采用PCR产物直接测序技术对 98头昭通牛样品的mtDNA D-loop区全序列变异进行检测,进一步将昭通牛的数据与已发表的云南文山牛、德宏高峰牛、滇中牛和迪庆牛的mtDNA数据进行联合分析.[结果]昭通牛mtDNA D-loop区序列共检测到 73个核苷酸替换位点和 3个插入/缺失.核苷酸替换位点约占检测核苷酸位点总数的 8.13%,其中 18个为单一信息位点,55个为简约信息位点,碱基替换主要为转换.在昭通牛群体中共确定 36种单倍型,其中 38.78%的个体属于H01～H09单倍型,源于瘤牛已发现的 2个mtDNA世系,I1世系占 37.76%,I2世系占 1.02%;其余 61.22%昭通牛个体分布于H10～H36单倍型中,都源于已发现的普通牛mtDNA世系,其中T2世系占 5.10%,T3世系占43.88%,T4世系占 12.24%.昭通牛群体的单倍型多样度为 0.880±0.027,核苷酸多样度为 0.024 43±0.000 94,群体内遗传距离为 0.026±0.004,群体内遗传多样性指数为 0.027±0.004.昭通牛与迪庆牛间的遗传距离和遗传分化最小,与德宏高峰牛间的遗传距离和遗传分化最大.[结论]昭通牛遗传多样性较丰富,与云南本地其他牛种存在一定遗传分化,在母系起源上为瘤牛和普通牛2个血统的混合起源,但受普通牛的影响较大.

关键词：昭通牛、线粒体DNA控制区、遗传多样性、母系世系、遗传分化

所属期刊栏目：38

分类号：S823.2(家畜)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;云南省应用基础研究重点项目;云南省应用基础研究重点项目

在线出版日期：2024-01-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：921-928