10.13597/j.cnki.maize.science.20220106
DAC对玉米DNA甲基化影响及基因表达量变化的研究
以5-氮杂-2脱氧胞苷(DAC)处理相应对照玉米幼苗叶片为材料构建转录组测序文库,采用Illumina测序平台进行测序,对差异表达基因进行GO功能分类和KEGG通路分析.最终筛选到差异基因1072个,其中,上调表达基因为646个,下调表达基因为426个.将差异基因富集的生物过程和信号通路进行GO分析,发现主要集中于细胞部分、细胞过程、代谢途径及催化活性等条目中.KEGG分析发现,差异基因主要集中在过氧化物酶体、半乳糖代谢、苯丙烷生物合成及植物激素信号转导等代谢通路中.结果 表明,代谢途径的细胞过程、代谢过程、催化活性、苯丙烷生物合成、过氧化物酶体、半乳糖代谢以及植物激素信号转导可能在玉米生长发育中起主导作用.通过亚硫酸盐测序对筛选的3个差异表达基因进行DNA甲基化水平分析,发现处理组CG、CHG位点甲基化率下降显著,由此表明DNA甲基化影响基因的表达.
玉米、DAC、差异表达基因、甲基化水平
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S513.035.3(禾谷类作物)
吉林省科技发展计划项目;国家自然科学基金
2022-03-14(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共10页
39-47,52