玉米生长调节因子(GRF)家族的全基因组鉴定及在非生物胁迫下的表达研究

摘要：

以拟南芥作为种子序列进行Blastp序列比对,共鉴定15个ZmGRFs基因,对其理化性质、系统进化关系等在非生物胁迫下的表达进行分析.根据系统发育树分析表明,ZmGRFs基因与单子叶植物水稻亲缘关系较近,15个ZmGRFs基因分别定位在1、2、4、5、6、7、9、10号染色体上且各个基因之间高度同源,每个亚族之间基因结构及保守基序均相对保守.ZmGRFs蛋白二级结构均以α-螺旋和无规卷曲为主.根据磷酸化位点预测分析表明,除ZmGRF6和ZmGRF9不含酪氨酸外,其他ZmGRFs蛋白均含有潜在的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点且各蛋白之间的潜在的磷酸化位点数目差异较大.根据转录组数据分析表明,ZmGRF4和ZmGRF13基因在NaHCO3上调表达,同时发现热、盐和干旱胁迫下ZmGRF4和ZmGRF13基因表达较高,冷胁迫下ZmGRF1/3/4/15基因表达较高.根据不同组织部位表达谱分析显示,ZmGRF4和ZmGRF13在各个部位表达均较高.

关键词：玉米、生长调节因子(GRF)、非生物胁迫、表达分析、生物信息学

所属期刊栏目：28

分类号：S513.035.3(禾谷类作物)

资助基金：黑龙江八一农垦大学优势特色学科建设项目专项2042070002

在线出版日期：2020-09-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：33-40,47