全外显子组测序联合SnaPshot技术分析华南地区汉族人增生性糖尿病视网膜病变的遗传易感性

摘要：

目的 研究增生性糖尿病视网膜病变(PDR)的遗传易感性.方法 采用横断面研究设计,纳入2011年9月至2012年2月在东莞眼病研究中确诊的2型糖尿病患者和2017年7月至2018年3月在广东省人民医院眼科诊治的相关患者共220例,其中100例糖尿病患者和120例PDR患者.采用全外显子组测序技术对22例不伴视网膜病变的2型糖尿病患者(糖尿病组)和23例PDR患者(PDR组)的外周血样本DNA进行单核苷酸多态性(SNP)、InDel等鉴定,筛选出其中具有显著差异的9个外显子区域位点,采用SnaPshot技术对78例不伴视网膜病变的2型糖尿病患者和97例PDR患者进行9个位点的SNP分型,并分析其单倍型和连锁不平衡性.结果 全外显子组测序检出75个位点SNP与PDR相关联(P＜0.01),涉及53个基因,其中11个位点位于外显子区,7个突变属于非同义突变.SnaPshot SNP分型技术验证其中9个显著差异的位点,发现其等位基因及基因型频率在PDR组和糖尿病组中差异无统计学意义(P＞0.05),但7种单倍型分布频率差异有统计学意义(P＜0.01),其中Hapl和Hap4可能会降低PDR的患病风险[均比值比(OR)＜1,P＜0.05)],Hap2可能会增加PDR的患病风险(OR＞1,P＜0.05). 结论 华南地区汉族2型糖尿病患者PDR的发生存在遗传易感性.

关键词：增生性糖尿病视网膜病变、汉族、遗传易感性、外显子组测序、SnaPshot

所属期刊栏目：36

资助基金：国家自然科学基金项目81371031;广东省自然科学基金项目2017A030313609;广东省医学科学技术研究基金项目A2018401National Natural Science Foundation of China81371031;Natural Science Foundation of Guangdong2017A030313609;Medical Scientific Research Foundation of GuangdongA2018401

在线出版日期：2018-11-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：774-779