基于生物信息学分析人TXNDC12基因在肝细胞癌的预后价值和作用机制

摘要：

目的 探讨人硫氧还原蛋白结构域蛋白 12(thioredoxin domain-containing 12,TXNDC12)基因在肝细胞癌中的表达情况、临床价值以及TXNDC12 参与肝细胞癌发生、发展的机制.方法 基于TIMER2.0 和GEPIA数据库分析TXNDC12 在肝细胞癌组织和正常组织的表达差异;选用GEPIA数据库、TCGA数据库分析TXNDC12 表达与肝细胞癌患者病理分期和生存预后的关系;选用Linked Omics数据库分析TXNDC12 在 TCGA-LIHC 中共表达基因;进一步探究TXNDC12 在肝细胞癌中发生、发展的上游调控机制,分析TCGA-LIHC中TXNDC12 的甲基化探针与基因表达水平和患者临床预后的相关性.再选用TCGA-LIHC分析TXNDC12 与免疫细胞的相关性.结果 生物信息学分析表明TXNDC12 在肝细胞癌组织中的表达显著高于正常组织.随着肿瘤分期的进展,TXNDC12 的表达量明显升高,在肝细胞癌患者中TXNDC12 高表达患者总体生存期明显低于低表达患者,且预后模型具有显著的预测效果.与TXNDC12 正相关的差异性表达基因有PPIH、MAGOH和BTF3L4 等,与TXNDC12 负相关的差异性表达基因有IRF6、LOC100130093 和GPR17 等.在肝细胞癌中,TXNDC12 的高表达可能与TXNDC12 基因启动子区内的甲基化水平低相关,TXNDC12 的表达与肿瘤的免疫细胞浸润有关.结论 TXNDC12 可作为肝细胞癌预后不良的标志物,TX-NDC12 在肝细胞癌中的高表达与甲基化有关,并且其可能通过免疫细胞浸润调控肝细胞癌的发生与发展.

关键词：硫氧还原蛋白结构域蛋白12、肝细胞癌、预后标志物、甲基化、免疫浸润

所属期刊栏目：51

分类号：R735.7(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;云南省应用基础研究计划项目

在线出版日期：2023-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：684-692