基于生物信息学分析TGFBI基因在头颈部鳞癌中的表达及其预后意义

摘要：

目的 探讨转化生长因子 β诱导基因(transforming growth factorβ-induced gene,TGFBI)在头颈部鳞癌(head and neck squamous carcinoma,HNSC)中的表达及其预后意义.方法 首先通过TIMER2.0数据库分析TGFBI基因在泛癌中的表达水平;并进一步利用UALCAN数据库和GEPIA数据库检索TGFBI基因在HNSC与正常组织中的表达水平,以及TGFBI基因与患者种族、年龄、性别、肿瘤分期、淋巴结转移状况等相关临床特征的关系;通过STRING数据库分析TGFBI基因的互作蛋白,借助DAVID数据库对其与互作蛋白基因进行功能富集分析;最后通过GEPIA数据库分析TGFBI基因在HNSC中的生存意义.结果 发现TGFBI在HNSC中的表达明显高于正常组织(P<0.05),TGFBI高表达的患者总生存期明显低于低表达的患者(P<0.05).蛋白互作分析发现,FN1、MMP14、IT-GA3、ITGAM、ITGAV、ITGB1、ITGB2、ITGB3、TGIF2和TGIF2LX这10个蛋白基因与TGFBI存在紧密联系,此外,TGF-BI及相关基因功能富集分析显示它们主要参与了5个生物学程序、4个细胞组分、3个分子功能、4个信号通路.结论 TGFBI在HNSC中的表达水平较正常组织明显升高,且与患者预后不良有关,有望成为HNSC诊断和治疗的生物学靶点.

关键词：转化生长因子β诱导基因、头颈部鳞癌、生物信息学、预后

所属期刊栏目：51

分类号：R739.6(肿瘤学)

资助基金：大学生创新创业训练计划项目;右江民族医学院校级科研课题

在线出版日期：2023-03-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：102-108