狼疮性肾炎相关基因的共表达网络构建与分析

摘要：

目的 基于基因表达综合数据库(GEO)挖掘与狼疮性肾炎(LN)相关的潜在基因.方法 从GEO中搜集LN相关的样本,获得GSE32591、GSE81622、GSE99967共3个数据集.利用GEO2R平台对这3个数据集进行分析,筛选出共同差异基因,并利用在线分析工具DAVID完成GO富集分析和KEGG通路富集分析.将筛选出的共同差异基因导入STRING在线数据库,构建共同差异基因的蛋白-蛋白相互作用网络,利用Cytoscape软件进行模块分析并识别枢纽基因.结果 筛选得到110个共同差异基因.GO富集分析发现这些基因主要参与了防御反应、免疫反应、对病毒的反应、对细菌的反应、对伤害的反应、炎症反应等生物学过程.KEGG通路富集分析主要包括了系统性红斑狼疮、抗原处理和呈递、补体与凝血级联、RIG-I样受体等信号通路.从最显著基因模块中识别出10个枢纽基因:RSAD2、OAS1、MX1、ISG15、DDX58、IFIH1、IFI44、IFI44L、IFIT1、IFIT3.结论 生物信息学分析显示RSAD2、OAS1、MX1、ISG15、DDX58、IFIH1、IFI44、IFI44L、IFIT1、IFIT3可能是与LN相关的枢纽基因,为LN的机制研究提供了一种全新的思路.

关键词：狼疮性肾炎、生物信息学、基因、共表达网络

所属期刊栏目：48

分类号：R593.24+2(全身性疾病)

资助基金：国家自然科学基金;广西自然科学基金

在线出版日期：2020-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：407-414