基于组LASSO的重组近亲杂交合作小鼠基因位点定位研究

摘要：

重组近亲杂交合作小鼠品系(CC-RIX)具有很多优点,特别是在复杂疾病的数量性状位点定位方面,具有较高功效.本文在现有研究基础上,考虑了仅含主基因效应的混合线性定位模型,并通过组LASSO惩罚函数法对问题进行转换,然后采用迭代加权最小二乘法对转换后的问题进行求解.从而克服了设计矩阵容易奇异,计算速度慢等计算上的难题.模拟计算表明,本文所提模型和方法在CC-RIX品系的数量性状位点定位中能快速、准确地识别出数量性状位点,并具有较高的真阳性率,以及较低的假阳性率.

关键词：重组近亲杂交合作小鼠、数量性状位点定位、组LASSO、迭代加权最小二乘法

所属期刊栏目：34

分类号：O212.1(概率论与数理统计)

资助基金：东华理工大学博士启动基金;国家自然科学基金;江西省自然科学基金

在线出版日期：2021-04-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：489-497