拟南芥抗旱转录因子CBF4基因区域的核苷酸多样性及其分子进化分析

摘要：

以生长于不同气候条件下的17个拟南芥核心生态型为材料,分析了它们的抗旱转录因子CBF4 基因区域的序列多态性.结果表明:拟南芥CBF4基因区域具有高密度的单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失(Indel),多态性频率为每35.8 bp一个 SNP,每143 bp一个Indel,基因非编码区的多态性是编码区的4倍;在编码区,SNP的频率为每96.4 bp一个SNP,其中发现25 av、203 av和244 av 3个生态型CBF4基因区域1 034位 (以GenBank登录号AB015478序列第19 696位的核苷酸为1)碱基变化:G(←→)T,引起第205位氨基酸变化:gly(←→)val.核苷酸多样性统计分析显示,该基因内部大范围内存在连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD),5′端非编码区有一个重组.与拟南芥等的研究结果类似,选择压力对不同的区域作用不同.3′端非编码区核苷酸多样性程度最高,是平衡性选择的结果,编码区核苷酸变化符合中性突变假说,而5′端非编码区是自然选择作用的靶位点.

关键词：拟南芥、CBF4基因、核苷酸多样性

所属期刊栏目：31

分类号：Q943.2(植物学)

资助基金：北京市科委科研项目H012010240240113,H020821150130;中-法合作项目中法PRA BT02-2;国家重点基础研究发展计划973计划2003CB114300

在线出版日期：2005-03-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1415-1425