用RAPD标记对栽培稻F1花粉不育基因座S-b定位

摘要：

S-b是栽培稻F1花粉不育基因座位之一,在S-b基因座,台中65的基因型为Sj/Sj,而台中65(简称T65)的近等基因系TISL2的基因型为Si/Si.通过F2群体和BC1F1群体的遗传分析表明,台中65和TISL2的F1花粉不育性由一个基因座控制,S-b基因座的等位基因Si和Sj相互作用,导致携带Sj基因的花粉败育,产生染败花粉.用187个RFLP标记和500个RAPD引物分析了T65和TISL2间的多态性,结果只有2个RAPD扩增片段H08-1300和Y09-1500在T65和TISL2间表现为多态,经Southern杂交分析,H08-1300和Y09-1500在水稻基因组中为单拷贝序列,并把H08-1300转化为RFLP标记,经F2群体的共分离分析表明,H08-1300和Y09-1500在F2群体中呈明显的偏态分离,用MAPMAKER/EXP3.0计算,H08-1300和Y09-1500与S-b基因座间的遗传距离分别为1.3cM和6.6cM.克隆和测定了H08-1300两侧的部分DNA序列,经同源性分析发现:右末端580bp的序列中有101bp的序列与水稻第五染色体的克隆P0033D06(注册号:AC079357)有94%的同源性,左末端中540bp的序列与P0033D06有86%的同源性,由于P0033D06为由位于水稻第五染色体定位18.8cM处的标记R3166锚定,结果说明S-b基因座位于水稻第五染色体上,与R3166的遗传距离为1.3cM.同时还讨论对于应用基因组测序的结果进行RAPD标记染色体定位的方法.

关键词：水稻、F1花粉不育、RAPD标记、染色体定位

所属期刊栏目：29

分类号：Q943(植物学)

资助基金：美国洛克菲勒兄弟基金会资助项目

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：700-705