普通烟草ALMT基因家族的鉴定与表达分析
为了挖掘可能参与烟草氯离子吸收转运的铝激活苹果酸转运蛋白(Al-activated malate transporter,ALMT)基因家族成员,利用生物信息学方法,系统地分析了烟草ALMT基因家族成员的蛋白理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构和保守结构域等;利用qPCR的方法分析了烟草ALMT基因在不同组织中的表达情况,以及在盐(NaCl)处理下的表达特征.结果表明:普通栽培烟草基因组中鉴定出30个可能的ALMT家族基因,根据系统发育树可将其划分为五个亚组;NtALMT基因的基因结构和motif分布与其他物种一致,具有高度保守的WEP motif;组织表达特异性分析结果发现大多数NtALMT基因在茎中表达较高,只有NtALMT28在叶中表达量最高;氯盐处理下,茎中NtALMT10表达量升高8倍以上,叶中NtALMT19表达量升高25倍以上,暗示了这些基因可能与烟草氯离子吸收转运相关.
烟草、ALMT基因家族、氯盐胁迫、表达分析
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TS414(烟草工业)
国家烟草专卖局烟草基因组重大专项项目"烟草氯离子调控功能基因研究;低氯离子含量的育种材料创制"110202001018JY-01;中国烟草总公司郑州烟草研究院院长科技发展基金项目"烟草氯离子吸收转运相关基因的筛选及鉴定"
2020-06-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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