烟草miRNA169基因家族及启动子的生物信息学分析
miRNA169是介导植物低温早花的关键因子.为了明确低温诱导烟草miRNA 169基因家族表达的调控机制,培育耐低温抗早花的烟草新品种,对miRBase数据库中烟草miRNA 169基因数据进行了分析,并对该基因家族及其启动子的结构和功能进行了预测.结果表明:在烟草基因组中共有19个miRNA 169基因,分布在1号、8号和9号染色体上,同一染色体上的miRNA 169分布集中.除pre-miRNA 169t外,其他pre-miRNA 169均具有很高的同源性.同时,在所有烟草miRNA 169的启动子上均发现低温胁迫应答元件LTR,以及参与低温应答的激素脱落酸(ABA)和茉莉酸(JA)的应答元件.因此,推测烟草miRNA 169对低温胁迫的响应过程可能是LTR、ABA和JA途径三者共同作用的结果.
烟草、基因家族、miRNA 169、生物信息学、低温胁迫、启动子
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TS413(烟草工业)
中国烟草总公司基因组计划重大专项项目"烟草抗病毒新基因NtTCTP功能研究及K326和云烟87品种PVY和TVBMV病毒病抗性的定向改良"110201801026JY-03;中国烟草总公司贵州省公司项目"烟草低温早花早期应答因子的筛选与抗性材料的创制"201501;烟草行业品质与生态重点实验室项目"控制烤烟叶片氮素分配的分子机制研究"110201603009
2019-12-04(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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