DNA甲基化驱动的转录表达特征作为肝癌预后预测标志物的价值

摘要：

肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,简称肝癌)是最常见的恶性肿瘤之一.DNA甲基化的异常是恶性肿瘤的特征之一,并被发现在肝癌等肿瘤的发生发展中发挥重要作用.为了能为肝癌患者提供新的临床预后预测标志物,本研究首先采用整合组学分析策略在全基因组范围内鉴定与肝癌患者预后相关的DNA甲基化驱动的差异表达基因;然后,采用LASSO(least absolute shrinkage and selection operator)分析建立了10个最优基因组合的预后预测模型.Cox比例风险回归分析显示,在校正临床特征参数后,此预测模型高风险评分与患者不良预后显著相关,表明该模型具有潜在的独立预后价值.受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析显示该风险评分模型在预测患者短期和长期预后方面优于其他已被报道的肝癌预后预测模型.基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)表明,高风险评分与细胞周期和DNA损伤修复通路相关.以上结果表明,本研究构建了一个基于10个DNA甲基化驱动基因的预后风险评分模型,该模型可作为肝癌患者的潜在预后生物标志物,有助于肝癌患者的生存预后评估和治疗策略的指导.

关键词：肝癌、转录组、表观基因组、预后模型

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资助基金：国家科技重大专项艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项项目编号, 2018ZX10732202, 2017ZX10203205

在线出版日期：2020-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：775-787