细菌全基因组关联研究的方法与应用

摘要：

随着测序技术的发展和全基因组序列的不断积累,全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)在人类复杂疾病研究中取得了丰硕成果,10余年间发现了数以万计的疾病风险因子.同样,GWAS也为探索细菌表型的遗传机制提供了新的工具.自2013年第一项细菌GWAS(bacterial GWAS,BGWAS)工作发表以来,目前已有10多项相关研究报道,分别揭示了细菌宿主适应性、耐药性及毒力等表型的遗传机制,极大加深了人们对细菌遗传、进化及传播等方面的认识.本文对目前BGWAS的研究方法、应用成果及存在的问题进行了总结,并对BGWAS的研究前景进行了展望,旨在为微生物学领域开展BGWAS研究提供参考.

关键词：全基因组关联研究、细菌、全基因组测序、表型、遗传机制

所属期刊栏目：40

分类号：S18;S85

资助基金：病原微生物生物安全国家重点实验室自主课题编号:SKLPBS1405 Supported by the funding of the State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity SKLPBS1405

在线出版日期：2018-02-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：57-65