应用全外显子组测序筛查一高原肺水肿家系易感基因

摘要：

高原肺水肿(high-altitude pulmonary edema,HAPE)是一种高原特发性疾病,其发病与遗传因素有一定关联.本研究对一个HAPE相关的家系展开遗传学调查,然后利用外显子组测序筛查了包括先证者在内的6名HAPE病史成员以及先证者的母亲共7个成员的遗传变异,结果发现18个HAPE相关的潜在遗传变异(9个SNVs和9个Indels).利用SIFT,PolyPhen-2和PROVEAN等3种软件对这些遗传变异进行蛋白功能危害性分析,结果发现定位于CFHR4基因的SNV(p.L85F)以及定位于OXER1基因的SNV(p.R176C)具有高危害性,且OXER1的功能与HAPE低氧诱导通路存在高度关联,它们可作为该家系中HAPE相关的候选病理性变异.此外,还有部分SNVs(NMB p.S 150P、APOBp.14194T和EIF4ENIFl p.Q763P)以及Indels(KCNJ12 p.EE333-334E、ANKRD31p.LMN251-253 LN和OR2A14p.HFFC 175-178HFC),其遗传变异同样具有一定危害,可作为潜在的HAPE相关遗传变异.本研究首次通过外显子组测序直接筛选与一中国HAPE家系相关的遗传变异,为后续揭示HAPE发病机制提供了新线索.

关键词：高原肺水肿、家系、全外显子组测序、CFHR4、OXER1

所属期刊栏目：39

分类号：R6 ;R64

资助基金：国家自然科学基金项目31160232;青海省科技厅应用基础基金项目编号:2016-ZJ-706资助[Supported by the National Natural Science Foundation of China31160232;Basic Applied Study Foundation of Qinghai No.2016-ZJ-706]

在线出版日期：2017-04-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：135-142