CRISPR/Cas9系统中sgRNA设计与脱靶效应评估

摘要：

基于 CRISPR/Cas9系统介导的第三代基因组编辑技术，已成功应用于动物、植物和微生物等诸多物种的基因组改造。如何提高 CRISPR/Cas9技术的基因组编辑效率和最大限度降低脱靶风险一直是本领域的研究热点，而使用高效且特异的sgRNA(Small guide RNA)是基因组改造成功的关键性因素之一。目前，已有多款针对 CRISPR/Cas9技术的 sgRNA 设计和/或脱靶效应评估软件，但不同的软件各有优缺点。本文重点对16款sgRNA 设计和脱靶效应评估在线和单机版软件的特点进行了阐述，通过制定38项评估指标对不同软件进行了比较分析，最后对11种用于检测基因组编辑效率和脱靶的实验方法，以及如何筛选高效且特异的sgRNA进行了归纳总结。

关键词：CRISPR/Cas9系统、基因组编辑、sgRNA、脱靶效应

分类号：V44;TN7

资助基金：中央高校基本科研业务费专项资金资助项目编号2662015BQ005;广东省分子与细胞工程育种团队编号2011A020102003;国家自然科学基金项目编号31301226

在线出版日期：2015-12-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：1125-1136