DNA甲基化分析中重亚硫酸盐处理DNA转化效率的评估方法

摘要：

为建立一种评估重亚硫酸盐处理DNA样本后胞嘧啶转化效率的有效方法，以两组不同的TaqMan qPCR检测梯度稀释的重亚硫酸盐处理和未处理的DNA标准品，建立转化与未转化的DNA Ct值以及对应的DNA拷贝数的标准曲线。使用相同的探针定量检测重亚硫酸盐处理后的 DNA样本评估转化效率。结果显示该方法应用两组探针，根据相应的标准曲线，精确评估样本经重亚硫酸盐处理的转化效率。使用已知转化和未转化拷贝数的混合 DNA 作为模板，证实了该方法的可靠性。同时也对不同重亚硫酸盐试剂盒处理 DNA 的转化效率进行了评估，结果显示，该方法能够有效地评估 DNA 样品重亚硫酸盐的转化效率，为 DNA 甲基化准确分析提供了可靠快捷的方法。

关键词：DNA甲基化、重亚硫酸盐、TaqMan qPCR、转化率

分类号：R9 ;O65

资助基金：国家自然科学基金项目编号81171965，81372237;国家重点基础研究发展计划项目937计划编号2012CB517605

在线出版日期：2015-10-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：939-944