癌症相关microRNA与靶基因的生物信息学分析
MicroRNAs(miRNAs)是一类长度约为22nt的内源性非编码RNA,通过与靶基因转录本互补结合调控基因的表达。近年来,研究发现miRNA与癌症发生密切相关,miRNA可以直接充当癌基因或者抑癌基因而影响肿瘤的发生和生长。为更进一步揭示癌症相关 miRNA的特征及靶基因的功能,文章通过数据库搜索及文献检索,在人类基因组中发现了475个癌症相关miRNA,系统地比较了癌症相关miRNA与非癌症miRNA以及基因内和基因间区癌症相关 miRNA 在保守性、SNP 位点分布、癌谱及转录调控等特性。研究发现,癌症相关miRNA比非癌症miRNA保守性要强,发生SNP概率比较低,同时发现miRNA所涉及癌症数目与保守性成正相关。基因组定位分析发现,癌症相关 miRNA 比非癌症 miRNA 更倾向于成簇存在。进一步对宿主基因、癌症相关 miRNA 及作用的靶基因与癌症发生进行关联分析,发现一些非癌症 miRNA 的宿主基因倾向于被癌症miRNA作用。本研究结果为深入理解miRNA与癌症之间的关系,以及进一步为miRNA作为癌症诊断指示物提供理论依据。
MicroRNAs(miRNAs)、癌症、靶基因、宿主基因、生物信息学
R39;R73
南京师范大学泰州学院青年项目编号Q201206
2015-10-12(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共10页
855-864