癌症相关microRNA与靶基因的生物信息学分析

摘要：

MicroRNAs(miRNAs)是一类长度约为22nt的内源性非编码RNA，通过与靶基因转录本互补结合调控基因的表达。近年来，研究发现miRNA与癌症发生密切相关，miRNA可以直接充当癌基因或者抑癌基因而影响肿瘤的发生和生长。为更进一步揭示癌症相关 miRNA的特征及靶基因的功能，文章通过数据库搜索及文献检索，在人类基因组中发现了475个癌症相关miRNA，系统地比较了癌症相关miRNA与非癌症miRNA以及基因内和基因间区癌症相关 miRNA 在保守性、SNP 位点分布、癌谱及转录调控等特性。研究发现，癌症相关miRNA比非癌症miRNA保守性要强，发生SNP概率比较低，同时发现miRNA所涉及癌症数目与保守性成正相关。基因组定位分析发现，癌症相关 miRNA 比非癌症 miRNA 更倾向于成簇存在。进一步对宿主基因、癌症相关 miRNA 及作用的靶基因与癌症发生进行关联分析，发现一些非癌症 miRNA 的宿主基因倾向于被癌症miRNA作用。本研究结果为深入理解miRNA与癌症之间的关系，以及进一步为miRNA作为癌症诊断指示物提供理论依据。

关键词：MicroRNAs(miRNAs)、癌症、靶基因、宿主基因、生物信息学

分类号：R39;R73

资助基金：南京师范大学泰州学院青年项目编号Q201206

在线出版日期：2015-10-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：855-864