番茄热激蛋白90的全基因组鉴定及分析
热激蛋白90(Heat shock protein 90，Hsp90)是植物应对不良环境胁迫产生的一类特定的抗逆蛋白。文章以番茄(Solanum lycopersicum L.)基因组数据为平台，借助生物信息学方法对Hsp90基因家族进行鉴定与分析。结果表明，番茄至少含有7个Hsp90基因，不均匀分布在6条染色体上，氨基酸序列长度为267~794aa，内含子数目为2~19；共线性分析发现两对基因(Hsp90-1和 Hsp90-3，Hsp90-5和 Hsp90-7)以片段重复形式存在。MEME(Multiple Em for Motif Elicitation)分析显示，番茄Hsp90基因编码的氨基酸序列具有多个保守基序；聚类分析揭示番茄、水稻(Oryza sativaL.)和拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)Hsp90基因可以分为5组，存在3对直系同源基因和4对旁系同源基因；基于RNA-seq数据库表达分析发现，3个基因(Hsp90-5、Hsp90-6和Hsp90-7)在营养器官和生殖器官中表达量较高，4个基因(Hsp90-1、Hsp90-2、Hsp90-3和Hsp90-4)除在番茄转色后10 d的果实中表达量较高外，其余组织中表达量均较低；对Hsp90基因启动子序列进行分析，发现了多个参与植物对逆境胁迫的顺式作用元件，如 HSE、CCAAT-box。此外，qRT-PCR 检测结果表明，在叶片热胁迫条件下，番茄Hsp90基因的表达量均存在增强趋势，表明这些基因参与了番茄叶片应对高温胁迫的反应。研究结果为鉴定番茄Hsp90基因的功能和进化起源奠定了基础。
番茄、热激蛋白、基因重复、表达分析
S85;S82
国家自然科学基金项目编号31301774，31272156;浙江省优先主题农业项目编号2011C12004;国家大宗蔬菜产业技术体系编号CARS-25-G-16;浙江省农业新品种选育重大科技专项编号2012C12903;公益性行业农业科研专项经费编号201003065;国家科技支撑计划项目编号2012BAD02B02;浙江省蔬菜产业创新团队项目编号2009R50026
2014-11-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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