利用传递不平衡分析在多群体中鉴别猪脐疝易感基因
在本实验室前期利用白色杜洛克×二花脸F2资源家系开展脐疝易感位点全基因组扫描定位的基础上，文章在7号染色体上的SWR1928和10号染色体上的SW830易感标记区域，结合脐疝发病机制在多群体中进行脐疝位置功能候选基因的筛选和易感位点的精细定位。在两个显著关联的微卫星位点区域搜寻到12个位置功能候选基因，采用比较测序法，选取12个候选基因内共计40个SNP位点在白色杜洛克×二花脸资源家系F2/F3脐疝群体中进行基因分型，利用Plink v1.07软件对基因型数据进行质量控制和传递不平衡(Transmission dise-quilibrium test，TDT)分析。结果表明，IL16(Interleukin 16)基因中的g.708C>T位点和CDC73(Cell division cycle 73)基因中的 g.10664G>A 位点与脐疝的关联性达到显著水平(P<0.05)。对这两个位点在西方商业猪种脐疝患病家系中进行基因分型和TDT验证分析，发现CDC73基因中的g.10664G>A位点仍与猪脐疝呈显著关联(P<0.05)。同时对 CDC73基因中与资源家系脐疝呈弱相关的两个 SNP位点 g.10546A>G和 g.10811A>G在西方商业猪种中进行 TDT 验证分析，发现这两个 SNP 位点与商业猪种脐疝发生的关联性达到极显著水平(P<0.01)。根据文章的分析结果，结合脐疝发生的生理机制及CDC73基因的生物学功能，推测CDC73基因可能为猪脐疝发生的易感基因。
猪、脐疝、位置功能候选基因、TDT分析、CDC73
R74;R69
国家自然科学基金项目编号31272422;教育部新世纪优秀人才计划项目编号教技函[2012]80;国家科技支撑项目编号2011BAD28B01;江西省现代农业产业技术体系建设专项资金编号JXARS-03资助。
2014-11-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共11页
995-1005
