下一代测序技术在表观遗传学研究中的重要应用及进展

摘要：

下一代测序技术(Next generation sequencing,NGS)的出现,极大地促进了表观遗传学的研究.将NGS技术引入表观遗传学,便形成了以NGS为基础的各种表观遗传学测序及研究方法,如:全基因组亚硫酸氢盐测序法(Whole genome bisulfite sequencing,WGBS)、简化代表性亚硫酸氢盐测序法(Reduced representation bisulfite sequencing,RRBS)、甲基化DNA免疫共沉淀测序(Methylated DNA immunoprecipitationsequencing,MeDIP-seq)、染色质免疫共沉淀测序(Chromatin immunoprecipitation-sequencing,ChIP-seq)、Tet辅助重亚硫酸盐测序法(Tet-assisted bisulfite sequencing,TAB-seq)、各种染色体构象捕获测序(Chromosome conformation capture sequencing,3C-seq)技术、Dnase Ⅰ-seq/MNase-seq/FAIRE-seq以及RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq).这些方法的应用和普及改变了人们对多种表观遗传现象的传统认识,使研究人员能够更加全面地深入了解各种表观遗传标志在机体内的广泛分布,以及如何在外界因素的影响下发生相应的动态变化.文章概述了当今主要商业NGS平台的原理和特点,系统介绍了以NGS方法为基础衍生出来的各种表观遗传学测序及研究方法,并在此基础上对近年来应用NGS技术在表观遗传学研究领域中取得的最新研究成果进行了综述.

关键词：下一代测序技术、表观遗传学、DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质构象捕获

所属期刊栏目：36

分类号：S85;S71

资助基金：美国国立神经病与中风研究所/美国国立卫生院及Coldwell基金会项目资助

在线出版日期：2014-04-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共20页

页码：256-275