蛋白质泛素化修饰的生物信息学研究进展
泛素-蛋白酶体系统(Ubiquitin-proteasome system,UPS)介导了真核生物80%~85%的蛋白质降解,该蛋白 质降解途径具有依赖ATP、高效、高度选择性的特点.除参与蛋白质降解之外,泛素化修饰还可以直接影响蛋 白质的活性和定位.由于泛素化修饰底物蛋白在细胞中的广泛存在,泛素化修饰可以调控包括细胞周期、细胞 凋亡、转录调控、DNA 损伤修复以及免疫应答等在内的多种细胞活动.近年来,泛素-蛋白酶体系统相关的蛋 白质组学数据不断产出,有效地管理、组织并合理分析这些数据显得尤为必要.文章综述了当前世界范围内针 对蛋白质泛素化修饰展开的生物信息学研究,总结了前人的工作结果,包括UPS 相关蛋白质数据的收录、泛素 化修饰网络的构建和分析、泛素化修饰位点的预测及泛素化修饰motif 的研究等方面内容,并对该领域未来的 发展方向进行了讨论.
泛素-蛋白酶体系统(UPS)、泛素化修饰、生物信息学
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TQ9;R73
国家重大科学研究计划项目2012CB910300,2011CB910202;国家高技术研究发展计划项目"863"计划编号:2012AA020201 和蛋白质组学国家重点实验室开放课题基金项目SKLP-O201106
2013-03-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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