茶树CBF1基因密码子使用特性分析
转录因子CBF(C-repeat-binding factor)广泛存在于各种植物中,是植物抗逆过程中一个重要的调节因子.文章运用CHIPS、CUSP 和CodonW 在线程序对茶树(Camellia sinensis)CBF1 基因(CsCBF1)序列进行分析,并与茶树基因、模式植物基因组和其他植物CBF 基因进行比较,对了解CsCBF1 基因密码子使用特性,并为其选择合适的表达系统具有重要意义.结果表明:CsCBF1 基因与70 个茶树基因对密码子的使用有明显的差异,CsCBF1 基因偏好使用以G/C 结尾的密码子,而筛选的70 个茶树基因偏好使用以A/T 结尾的密码子.在密码子使用频率上,CsCBF1 基因与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、烟草(Nicotiana tobacum)的差异小于与小麦(Triticum aestivum)、玉米(Zea mays)的差异; 因此,拟南芥、烟草更适合作为CsCBF1 基因的外源表达宿主.通过分析40 种植物CBF 基因编码特点可知大部分CBF 基因偏好使用以G/C 结尾的密码子,这可能与基因的特殊功能有关.
茶树、CBF1基因、密码子偏好性
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Q94;S81
国家科技支撑计划项目2011BAD01B01;山东省科技发展计划2011GNC11010;山东省自然科学基金项目ZR2010CL021、2009ZRB01654
2013-01-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共10页
1614-1623
