人与小鼠核糖体蛋白基因内含子中的转录调控位点分析

摘要：

前期对酵母和果蝇核糖体蛋白(Ribosomal protein,RP)基因内含子序列中的寡核苷酸分析表明,内含子中含有潜在的转录因子结合位点.为进一步发掘核糖体蛋白基因内含子参与转录调控的证据,文章首先基于频率分析方法抽提出人和小鼠核糖体蛋白基因第一内含子中高频(Over-represented)出现的寡核苷酸片段 (亦称模体,Motif),这些寡核苷酸中超过85%与已知的转录因子结合位点吻合,是潜在的转录调控元件.对抽提出的寡核苷酸进行碱基组成分析,发现95%以上的寡核苷酸富含碱基C 和G,而较少富含A 和T.从寡核苷酸在内含子中的分布情况看,它们相对靠近第一内含子的5′端,即距离基因转录起始位点和上游区域较近.推测这些特征可能与基因转录调控有关.

关键词：人、小鼠、RP基因、内含子、转录调控

所属期刊栏目：34

分类号：R73;S8

资助基金：国家自然科学基金项目31160181;云南省应用基础研究基金项目2007A023M 和云南民族大学引进人才科研项目资助

在线出版日期：2013-01-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1577-1582