利用高密度SNP 检测不同猪品种间X 染色体选择信号

摘要：

在家猪的培育过程中,许多重要的经济性状受到过高强度的人工选择,高密度SNP 标记为通过选择信号检测追踪这些性状经历的选择提供了可能,并能根据选择信号利用生物信息学寻找到与选择相关的基因.X 染色体由于其特殊性,在传统的遗传分析中许多针对常染色体的方法往往不适用,需要采取特殊的方法,选择信号检测可以作为一种行之有效的方法对X 染色体进行分析.文章利用长白、松辽黑猪和大白3 个猪品种,通过品种间选择信号检测方法XP-EHH,利用高密度SNP 标记对X 染色体进行选择信号检测,并通过生物信息学分析寻找选择信号区域内重要基因.在长白、松辽黑猪和大白3 个品种中分别检测出29、13 和15 个选择信号区域,每个选择信号区域平均包含3.59 、4.92 、4.07 个SNPs,长白和松辽黑猪、长白和大白有部分重叠选择信号区域,大白和松辽黑猪没有发现重叠选择信号区域.生物信息学分析发现各品种选择信号区域内有与繁殖、免疫等性状相关基因,其中部分在猪中尚未见报道,可作为研究猪相关性状的重要候选基因.

关键词：X、染色体、选择信号、猪

所属期刊栏目：34

分类号：S82;G35

资助基金：国家自然科学基金项目30800776;教育部留学回国人员启动基金和北京市科技计划Z101105000810001 资助

在线出版日期：2012-12-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1251-1260