30株大肠杆菌的泛基因组学特征分析

摘要：

泛基因组(Pan-genome)是某一物种全部基因的总称,其中包括核心基因组(该物种所有个体中都存在的基因)和非必须基因组(只在部分个体中存在的基因,以及某个体特有的基因).文章从泛基因组学角度比较分析了30 株已经完成测序的大肠杆菌的基因、基因组成及其进化特征,结果表明核心基因只占据每株大肠杆菌全部基因数目的50%左右,而平均每个菌株有146 个特有基因,结果表明随着更多大肠杆菌菌株的基因组被测序,将会不断有新基因被发现.通过比较分析大肠杆菌不同菌株之间基因的保守性与基因的GC 含量以及选择压力之间的关系,发现越保守的基因其GC 含量变化范围越窄,同时在进化中受到的选择压力也越大.这些结果将有助于深入了解大肠杆菌基因组的进化特征及其基因组成的动态变化,并为预防和控制由致病性大肠杆菌引发的流行疾病提供理论依据,同时也为大规模病原菌基因组数据的分析方法提供借鉴.

关键词：泛基因组、大肠杆菌、GC含量、选择压力

所属期刊栏目：34

分类号：S85;TQ9

资助基金：国家杰出青年基金项目30725027

在线出版日期：2012-07-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：765-772