木本植物全基因组测序研究进展

摘要：

近年来,植物金基因组测序的结果正如雨后春笋般涌现,木本植物全基因组测序也在紧锣密鼓地展开.但由于木本植物通常基因组较大,基因组结构较为复杂,在测序、测序后的组装、注释、功能分析等均存在较大的困难.在基因组测序分析的经费预算方面也存在着较大的压力.因此,有必要对这方面的研究进展及其存在问题进行分析比较,以提高林木全基因组研究方面的效率.文章在比较分析已经发展起来的3代基因测序技术(Sanger测序法、合成测序法和单分子测序法)的基础上,选择4种已经公布的木本植物(杨树、葡萄、番木瓜、苹果),从全基因组测序的研究背景、测序结果及应用的研究进展和存在问题等方面进行了述评,对未来要开展的木本植物全基因组测序前的准备工作(材料选择、遗传图谱和连锁图谱的构建、测序技术的选择),全基因组测序结果的生物信息学分析和应用进行了讨论.

关键词：木本植物、测序技术、全基因组

所属期刊栏目：34

分类号：S85;R73

资助基金：国家自然科学基金重点项目30930077;国家自然科学基金青年项目30901156;国家林业局 948 引进项目2009-4-24;江苏高校自然科学基金项目09KJA220001;江苏省高校优势学科建设工程项目

在线出版日期：2012-04-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：145-156