香蕉EST-SSRs标记的开发与应用

摘要：

从NCBI搜索的2 282条香蕉EST中,发掘出含有SSR的EST序列110条,共有122个SSR位点,检出率为5.3%.SSR位点可分为37种重复单元,平均长度为20bp,其中二、三核苷酸重复单元的SSR占主导地位,分别占总SSR的33.1%和47.6%.GA和GAA是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复类型的75.7%和36.0%;其他重复类型所占比例均不足10%,而四核苷酸重复类型最少,为4.0%.设计的63对EST-SSRs引物中,有41对EST-SSRs引物对巴西蕉基因组DNA能扩增出产物,占总引物数的65.1%.应用进一步筛选出的重复性好、多态性高的19对引物对49个香蕉品种(系)进行PCR扩增.每对引物扩增的多态性带数目为4～12个,平均7.58个;引物多态信息量变化范围为0.3572～0.8744,平均0.7324.在相似系数为0.63的水平可将49个品种聚为2个类群:一类为含B基因组香蕉品种;另一类为不含B基因组的香蕉品种,表明EST-SSR引物可以应用于香蕉品种资源分类的研究.

关键词：香蕉、EST、EST-SSR、遗传多样性、聚类分析

所属期刊栏目：30

分类号：S43;S41

资助基金：国家自然科学基金30460070;海南省自然科学基金80436;科技部科技基础条件平台2005DKA21000-5-001;农业部南亚热作专项2007

在线出版日期：2008-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：933-940