糜子抗旱节水相关基因PmMYB的克隆及表达分析

摘要：

根据在糜子抗旱节水分子基础研究中获得的一个糜子MYB基因的EST序列,以其序列及水稻MYB18基因的序列为基础设计引物,扩增得到1 739 bp的全长基因组序列.序列分析表明,其包含121 bp(347～467 bp)和93 bp(599～691 bp)的两个内含子,3个外显子;全长cDNA序列为1 525 bp,其中3'非翻译区为212 bp,5'非翻译区为41 bp,编码区为1 272 bp,共编码424个氨基酸,C-端存在一个丝氨酸(Ser,S)丰富区.该基因具有两个典型的MYB类转录因子基因的DNA结合区(DNA-binding domain),分别为13～63、66～114位氨基酸,属于典型的R2R3-MYB转录因子.对其与水稻、玉米、火炬松、拟南芥、辣椒、陆地棉、大麦及茄子等9种植物的MYB基因的R2,R3重复区的氨基酸序列多重比较,表明R2R3重复序列在植物中具有较高的保守性;基于氨基酸序列的编码区系统进化树分析表明,不同植物的MYB基因遗传分化很大,序列相似性为32%～84%,其中糜子MYB基因与水稻的MYB18相似程度最高(84%),与大麦和玉米的相似性分别为46%和41%.通过半定量RT-PCR对其表达模式分析表明,该基因在水分胁迫和干旱后复水条件下上调表达,与糜子抗早节水紧密相关.该基因的克隆为进一步探讨利用该基因改良其他植物的抗旱节水性奠定了良好的基础.

关键词：糜子、MYB转录因子、基因克隆、表达模式、进化分析

所属期刊栏目：30

分类号：Q3(遗传学)

资助基金：西北农林科技大学科研基金面上项目2006ZR013;科技部973计划前期项目2006CB708208

在线出版日期：2008-05-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：373-379