植物病原细菌Ralstonia solanacearum GMI1000中分泌蛋白信号肽分析

摘要：

利用SignalP 3.0、TMHMM 2.0、TargetP 1.01、LipoP 1.0和PSORTb蛋白分析软件并结合L值计算,对植物病原细菌Ralstonia solanacearum GMI1000菌株基因组中的全部3 440个ORFs进行了分析预测,确定其中186个ORFs所编码蛋白质的N-端有信号肽序列,且它们的氨基酸残基相对保守.其中134条具有分泌型信号肽,22条具有RR-motif型信号肽,30条具有信号肽酶Ⅱ型信号肽.对各类信号肽及其结构域的长度作了系统的分析.未发现Prepilin-like信号肽和细菌素和信息素信号肽.

关键词：Ralstonia solanacearum、基因组、信号肽、蛋白分析

所属期刊栏目：29

分类号：Q94(植物学)

资助基金：重庆市自然科学基金8575;重庆大学自然科学青年基金

在线出版日期：2007-12-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1409-1416