10.3321/j.issn:0253-9772.2007.07.018
基于最小自由能和协变信息预测带伪结RNA二级结构的迭代化方法
多数RNA分子的结构在进化中是高度保守的,其中很多包含伪结.而RNA伪结的预测一直是一个棘手问题,很多 RNA二级结构预测算法都不能预测伪结.文章提出一种基于迭代法预测带伪结RNA二级结构的新方法.该方法在给潜在碱基对打分时综合了热力学和协变信息,通过基于最小自由能RNA折叠算法的多次迭代选出所有的碱基对.测试结果表明:此方法几乎能预测到所有的伪结.与其他方法相比,敏感度接近最优,而特异性达到最优.
RNA 二级结构、伪结、协变信息、最小自由能
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Q3(遗传学)
国家自然科学基金60673018;湖南省自然科学基金06JJ4123
2007-08-06(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共9页
889-897