基于耦合双向聚类技术的DLBCL异质性分析

摘要：

基因芯片技术为疾病异质性研究提供了有力的工具.当前基于传统聚类分析的方法一般利用芯片上大量基因作为特征来发现疾病的亚型,因此它们没有考虑到特征中包含的大量无关基因会掩盖有意义的疾病样本的分割.为了避免这个缺点,提出了基于耦合双向聚类的异质性分析方法(Heterogeneous Analysis Based on Coupled Two-Way Clustering,HCTWC)来搜索有意义的基因簇以便发现样本的内在分割.该方法被应用于弥漫性大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma DLBCL)芯片数据集,通过识别的基因簇作为特征对DLBCL样本聚类发现生存期分别为55%和25%的两类DLBCL亚型(P＜0.05),因此,HCTWC方法在解决疾病异质性是有效的.

关键词：基因表达谱、疾病异质性、超顺磁性聚类、概念一致性

所属期刊栏目：28

分类号：R394

资助基金：国家自然科学基金30170515;30370798;30571034;30570424;国家高技术研究发展计划863计划2003AA2Z2051;黑龙江省自然科学基金ZJG0501;F2004-02;国家"211"工程项目

在线出版日期：2006-10-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1129-1134