八肋游仆虫Rab家族新成员Eo-rab-1N基因的克隆与序列分析

摘要：

Rab蛋白家族属于小分子GTP结合蛋白家族Ras超家族中最大的亚家族,主要在囊泡运输中起作用.实验运用PCR、RT-PCR等技术,从八肋游仆虫中克隆到一种新的rab基因.序列分析结果表明:在大核中,该基因全长884 bp,除去两端的端粒与非编码区,该基因在大核中由723bp组成.从小核中克隆相应的基因片段,此基因片段序列与大核中序列一致,表明该基因在小核中无内部删除序列的存在.通过RT-PCR,从mRNA获得的该基因的开放读框为663 bp,表明该基因在转录过程中有内含子的删除.大核基因序列和cDNA序列比较,发现60 bp的内含子序列位于大核基因的153～212 bp之间,并符合一类内含子GU-AG剪切规则.在遗传密码使用上,该基因内部含有2个TGA,在游仆虫中编码半胱氨酸.同时首次发现,八肋游仆虫基因使用TAG作为终止密码子.NCBI上序列比对表明该基因翻译的蛋白与其他物种Rab1蛋白的同源性达49%～52%,因此我们将它命名为Eo-rab-1N,GenBank登录号为DQ105562.Eo-rab-1N与其他物种的Rab1蛋白构建进化树,发现该蛋白的进化与物种的进化保持一致,表明该基因在细胞中具有重要功能.

关键词：八肋游仆虫、Eo-rab-1N基因、基因克隆、内含子

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分类号：Q343(遗传学分支学科)

资助基金：中国科学院资助项目30270204,30300038;山西省自然科学基金20041033;国家重点实验室基金2004FB11

在线出版日期：2006-04-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：437-442