一个新的Br蛋白基因部分序列测定及分析

摘要：

从新疆北部艾比湖分离纯化到极端嗜盐古生菌AB1,采用PCR方法扩增了其16S rRNA基因(16S rDNA)和编码螺旋C至螺旋G的细菌视紫红质(bacteriorhodopsin,Br)蛋白基因片段,并测定了基因的核苷酸序列.基于16S rDNA序列的同源性比较及系统发育学研究表明,AB1是Natronococcus属中新成员.通过对菌株AB1的Br蛋白亲水性分析表明,AB1的Br蛋白与已报道Br蛋白有类似的超二级结构,进一步的蛋白质序列聚合比对结果表明,AB1中Br蛋白螺旋C至螺旋G的氨基酸序列与其他菌株差异明显.研究结果表明菌株AB1的Br蛋白是一种新的Br蛋白.

关键词：嗜盐古生菌、细菌视紫红质、16S rDNA

所属期刊栏目：26

分类号：Q517;Q78(蛋白质)

资助基金：国家自然科学基金30370029

在线出版日期：2004-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：343-348