长白山猪苓与陕西猪苓的菌丝体转录组差异比较分析

摘要：

长白山猪苓和陕西猪苓因地理隔离存在种间差异,为阐明长白山猪苓与陕西猪苓菌丝体间的基因表达特征,利用Illumina测序技术对长白山猪苓与陕西猪苓菌丝体的6份样品进行转录组测序,并对2种菌丝体的差异表达基因进行了比较分析.通过对转录组原始数据进行数据质控共得到133662个Transcript和20999个Unigene.差异表达分析结果表明:与陕西猪苓菌丝体相比,长白山猪苓菌丝体共有5881个表达差异基因出现,其中,上调基因有2616个,下调基因有3265个.差异基因GO注释分类表明,在细胞组分中,差异表达基因主要分布在膜、膜部分、细胞、细胞部分和细胞器;分子功能中,差异表达基因主要与催化活性、结合有关;而在生物学过程中,主要与代谢过程和细胞过程有关.差异表达基因KOG注释分类表明,差异表达基因主要与一般功能基因预测、蛋白质翻译后修饰与转运、伴侣蛋白,次生代谢产物的生物合成、转运和分解代谢,信号转导机制,脂质运输和新陈代谢,氨基酸转运和代谢等有关.差异表达基因KEGG分类表明,差异表达基因主要涉及到碳水化合物代谢,翻译,氨基酸代谢,脂质代谢,运输和分解代谢,信号转导,折叠、分拣和降解等.

关键词：猪苓、菌丝体、转录组测序、差异表达基因、功能注释

所属期刊栏目：41

分类号：S567.3(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金项目31160014

在线出版日期：2019-11-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1-8