长白山鸡爪苓菌核cDNA文库的部分EST序列生物信息分析

摘要：

探求由鸡爪苓菌丝体形成菌核的关键结构基因,为深入研究该珍稀药用真菌的生长发育、代谢调控以及优质种质资源的开发、利用与保护提供理论基础.从鸡爪苓菌核全长cDNA文库中随机筛选500个单独克隆进行单方向测序,选取3条全长的EST s序列进行蛋白质功能预测,并进行生物学信息分析.结果表明:获得455条有效的EST序列,经聚类分析得到单基因簇共349条,文库冗余度为23%;参照拟南芥功能分类标准,将BLASTx比对结果中具有已知功能的78条单基因簇分成9类,分别是代谢、能量、转录、蛋白质合成、细胞结构、胞内运输、信号转导、抗性防御及未确定分类;仅有183条获得1条或1条以上GO术语,其中细胞组分包括7个部分,分子功能包括5个部分,生物学过程包括16个部分.

关键词：鸡爪苓菌核、cDNA文库、EST分析、生物信息

所属期刊栏目：39

分类号：S567.3(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金项目31160014

在线出版日期：2018-01-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：7-16