基于网络药理学及分子对接方法分析川贝母治疗肺炎的分子机制

摘要：

目的:运用网络药理学分析方法和分子对接分析方法,分析川贝母治疗肺炎的分子机制,为后续研究提供理论依据.方法:根据已发表的文献和数据库及ADEM参数筛选川贝母的有效成分,在SwissTargetPrediction,Similarity ensemble approach等数据库上查找川贝母所有有效成分的靶点,在DisgeNet、GeneCards等数据库中查找肺炎的治疗靶点,通过韦恩图求靶点的交集即为川贝母治疗肺炎的治疗靶点,通过String数据库构建治疗靶点PPI网络图,运用Cytoscape3.8.0自带应用程序CytoNCA筛选出综合集中性前五的靶点即为川贝母治疗肺炎的核心靶点,在Metascape网站上进行靶点基因GO富集和KEGG通路富集,应用Cytoscape3.8.0构建有效成分和治疗肺炎靶点网络图,应用Discovery studio 2019中的Cdocker对选定有效成分和核心靶点进行分子对接.结果:共筛选出59种有效成分,包括生物碱类物质22种,有机酸类物质20种,核苷类物质8种,其他类物质9种,韦恩图筛选出100个川贝母治疗肺炎的靶点,经过集中性筛选选出川贝母治疗肺炎的5个核心靶点,分别为STAT3、AKT1、SRC、MAPK3和EGFR.GO富集和KEGG通路富集分析发现川贝母治疗肺炎的靶点分子功能富集于丝氨酸型肽酶活性、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、激酶绑定等,生物过程富集于白细胞游走、细胞与细胞黏附调节、防御反应调节等,细胞组分富集于膜筏区域、质膜外侧部、囊腔等部位,KEGG通路富集于癌症通路、糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路、乙肝通路等,其中核心靶点均参与的生物过程包括细胞因子信号通路和蛋白质的正调节过程,KEGG通路包括AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的作用、乙型肝炎、趋化因子信号通路等;分子对接显示川贝母的生物碱成分能与STAT3、AKT1进行分子对接,有机酸成分能与EGFR进行分子对接.结论:川贝母通过多种靶点、多通路和多途径治疗肺炎,活性成分具有良好的类药性.

关键词：肺炎、川贝母、分子机制、网络药理学、分子对接

所属期刊栏目：55

分类号：R259(中医内科)

在线出版日期：2023-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：7-16