甘薯WRKY转录因子编码基因IbWRKY53L的生物信息学及表达特性分析

摘要：

WRKY作为植物中最大的转录因子家族之一,广泛参与了植物对多种环境逆境的响应过程.以甘薯徐薯22为研究材料,通过转录组分析筛选出受盐胁迫诱导的IbWRKY53L基因.序列分析发现,IbWRKY53L基因编码363个氨基酸残基,该蛋白具有1个WRKYGQK保守结构域和1个C2 H2型锌指结构,结合进化树分析表明,其属于Ⅱ d亚组WRKY转录因子成员.生物信息学分析显示,IbWRKY53L蛋白位于细胞核,为不稳定亲水性蛋白,不存在信号肽以及跨膜结构域,含有多个潜在的磷酸化位点.qRT-PCR分析表明,IbWRKY53L基因的表达受NaCl、冷及热胁迫的诱导,且对ABA、JA和SA激素也有不同程度的应答.这些结果将为深入探究IbWRKY53L基因在甘薯非生物胁迫应答中的潜在功能奠定基础.

关键词：甘薯、基因表达、生物信息学分析、WRKY转录因子

所属期刊栏目：40

分类号：Q812;S531(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家自然科学基金;徐州市科技计划项目;现代农业产业技术体系;江苏高校优势学科建设工程项目

在线出版日期：2023-01-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：22-27