甘薯近缘种三浅裂野牵牛核基因组密码子分析

摘要：

三浅裂野牵牛(Ipomoeatrifida)是甘薯的亲缘关系较近野生种之一.分析了三浅裂野牵牛的32264个具有完整编码框的核基因组基因,长度为165～15273个核苷酸.根据基因在根、茎、叶中的表达量,选择1382个低表达基因和1644个高表达基因.利用CodonW软件分析发现,总基因的密码子有效数(ENC)为53.04,低表达基因的为52.80,高表达基因的为52.01.在总基因、低表达基因和高表达基因中分别发现了3个、9个和5个高频密码子.对低、高表达基因密码子的偏好性分析发现,高表达基因的进化速度低于低表达基因的.研究丰富了植物基因密码子理论,为转基因研究中密码子的优化提供了依据.

关键词：三浅裂野牵牛、高频密码子、基因进化

所属期刊栏目：37

分类号：S531(薯类作物)

资助基金：国家重点研发计划资助项目2018YFD1000701-5 ,2018YFD1000705 ,现代农业产业技术体系建设专项资金CARS-10-B07 ,山东省现代农业产业技术体系薯类创新团队建设项目SDAIT-16-04 ,山东省农业科学院作物研究所学科团队建设项目CXGC2018E01

在线出版日期：2019-12-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：26-30