基于RNA-Seq技术分析大肠埃希菌诱导阴道上皮细胞炎症反应分子机制

摘要：

目的 研究大肠埃希菌感染诱导阴道上皮细胞炎症反应的分子机制.方法 制备大肠埃希菌刺激阴道上皮细胞炎症反应模型,采用RNA测序(RNA-Seq)获取对照组和大肠埃希菌刺激组间的差异表达基因谱,进而使用生物信息学分析差异表达基因的富集信号通路,实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证测序结果.结果 在对照组和大肠埃希菌刺激组间共发现 4 899 个差异表达基因,其中上调和下调基因分别为 1 531 和 3 368 个.基因本体论(GO)分析显示,其功能富集在生物学行为控制模块的血小板衍生生长因子结合和辅助因子结合、细胞组成模块的内质网伴侣复合物,以及分子功能模块的内质网折叠蛋白方面.京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析显示这些基因富集于 39 条信号通路,如核因子-κB(NF-κB)通路.RT-qPCR结果与RNA-Seq结果一致,证实大肠埃希菌刺激组细胞TNF-α表达上调(P＜0.05).结论 TNF-α调控NF-κB信号通路可能是大肠埃希菌诱导阴道上皮细胞炎症反应关键分子机制.

关键词：RNA测序、大肠埃希菌、需氧菌性阴道炎、炎症反应

所属期刊栏目：54

分类号：R722.13;R-332;R575.2

资助基金：中山市社会公益科技研究专项项目2018B1001

在线出版日期：2023-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：511-516