10.3969/j.issn.1003-0972.2020.04.010
茶树NAC基因的鉴定及其在逆境反应中的表达调控分析
利用隐马可夫模型检索和同源比对的方法,从茶树基因组鉴定出108个NAC成员(CsNAC).理化特征、进化关系、基因结构和保守基序分析表明,CsNAC蛋白长度在134~1950个氨基酸之间,分子量介于15.4~222 kD,等电点介于4.60~9.91,大部分为亲水性蛋白(除CsNAC97).其中,CsNAC3、8、14、23、32、74、82、90、106蛋白含跨膜结构域.进化分析将CsNAC家族分为18个亚类,ONAC022和NAP亚类成员最多,AtNAC3和OsNAC8亚类成员最少.CsNAC基因启动子区富含响应干旱、低温、盐胁迫以及病原菌侵染的序列元件.据转录组数据分析结果,CsNAC基因家族成员在不同组织和胁迫处理后呈现显著的表达差异.低温和干旱胁迫下的CsNAC共表达网络中,ABA参与调控其关键基因的表达;KEGG分析显示,信号传递、糖代谢、植物与病原菌互作等途径存在显著富集.
茶树、NAC转录因子、逆境反应、表达调控
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Q601
国家自然科学基金项目;河南省科技计划项目;安徽省研究人员科研基金项目;河南省教育厅高等教育教学改革研究;实践项目;信阳师范学院"南湖学者奖励计划"青年项目;信阳师范学院大学生科研基金项目
2020-10-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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