大豆bHLH转录因子家族成员的进化及功能分化研究

摘要：

碱性螺旋-环-螺旋蛋白(basic Helix-Loop-Hleix,bHLH)转录因子家族是动植物中最大的转录因子家族之一,主要由碱性氨基酸区域和螺旋-环-螺旋区域组成,在动植物生长发育和胁迫应答反应中发挥着重要作用.本研究通过对大豆全基因组生物信息学分析和分子生物学研究手段,深入研究了大豆bHLH基因家族的进化机制,同时探讨了该基因家族在大豆中的功能分化.结果表明,大豆中含有340个非冗余的bHLH基因家族成员,通过对这些成员的Pfam蛋白结构域、Motif组成和系统进化关系的分析,将这些成员分为15组共24个亚家族,在大豆20条染色体上呈现不均匀分布.bHLH理化性质差异较大,编码的大豆氨基酸数量为91～815 aa,相对分子量为10 273.88～91 300.38,理论等电点为4.56～10.40;碱性氨基酸区含有His5-Glu9-Arg13保守序列,与靶基因结合有关,HLH区含有Arg23和Arg55,与形成二聚体有关,同时含有5种保守元件.多数成员在大豆根以及花发育的5个时期中具有组织表达特异性,不同基因表达量差异较大.

关键词：大豆、bHLH、转录因子、系统发育分析、表达分析

所属期刊栏目：32

分类号：Q941(植物学)

资助基金：国家自然科学基金项目U1604112;信阳师范学院南湖青年学者奖励计划;信阳师范学院研究生科研创新基金资助项目2017KYJJ42

在线出版日期：2019-04-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：27-38