基于TCGA数据库分析胸苷酸合成酶基因在食管癌组织中的表达及临床意义
目的 探讨胸苷酸合成酶(TYMS)基因在食管癌(ESCA)患者中的表达及其与临床特征和预后的关系.方法 从癌症基因组图谱数据库下载ESCA患者的原始转录组测序数据、临床信息及临床病理学资料,应用t检验和χ2 检验评估TYMS基因在食管癌组织与正常组织间的表达差异,受试者操作特征(ROC)曲线评估TYMS基因对ESCA的诊断价值;Kaplan-Meier生存分析比较不同表达TYMS水平ESCA患者的无进展间隔(PFI)率、总生存(OS)率和疾病特异性生存(DSS)率;应用Cox回归分析和预后列线图确定 TYMS基因对ESCA预后的评估价值;并使用单样本基因集合富集分析免疫浸润水平与TYMS基因表达的相关性.结果 共获取 173 例样本的临床病理学资料,其中 11 例为正常样本,162 例为ESCA 样本.总样本中,ESCA 组织中 TYMS 基因表达水平显著高于正常样本(t =6.344,P＜0.001);在 8 例配对ESCA和邻近癌旁组织中,ESCA组织中TYMS基因表达水平显著高于邻近癌旁组织(t =6.866,P＜0.001).TYMS高表达组与TYMS低表达组患者的临床分期、病理分级、是否行放射治疗及是否为Barrett食管比较差异无统计学意义(P＞0.05);2 组患者的年龄、体质量及组织学分型比较差异有统计学意义(P＜0.05).ROC曲线显示,TYMS基因诊断ESCA的曲线下面积为 0.949,95%置信区间为 0.896～1.000,敏感度为 0.909,特异度为0.791.TYMS基因高表达与TYMS基因低表达患者的OS率、DSS率和PFI率比较差异无统计学意义(HR=0.940、1.040、0.980,P＞0.05).在体质量＞70 kg的ESCA患者中,TYMS基因高表达患者的OS率显著低于TYMS基因低表达患者(P＜0.05);在非Barrett食管疾病的ESCA患者中,TYMS基因高表达患者的OS率显著低于TYMS基因低表达患者(P＜0.05).在不同T、N、M分期及病理分级、是否行放射治疗、不同年龄段、食管癌、Barrett食管疾病及体质量≤70 kg 患者中,TYMS基因高表达与TYMS基因低表达患者的OS率比较差异无统计学意义(P＞0.05).从ESCA患者体质量及非Barrett食管ESCA患者2 个方面,构建TYMS 基因水平预测ESCA患者生存列线图显示,随总分值的增加,1、2、3 a生存率下降;预后列线图的C指数达到0.563(0.474～0.650),所建立的 1、2、3 a存活曲线与理想存活曲线匹配.单因素分析显示,M、N 期和初次治疗结果与ESCA患者的OS 率相关(P＜0.05),TYMS 基因表达水平与ESCA患者的OS率无关(P＞0.05).多因素分析显示,肿瘤分期M、N 期是影响ESCA患者生存期的独立危险因素(P＜0.05).TYMS基因表达水平与肥大细胞、嗜酸性粒细胞、树突状细胞和辅助性T细胞 17 的表达水平呈负相关(r=0.302、0.244、0.256、0.270,P＜0.05).结论 TYMS基因在ESCA组织中高表达,可调节ESCA免疫微环境,不同程度促进肿瘤发展;TYMS基因表达水平并非ESCA患者的独立预后影响因素,可作为ESCA的诊断和部分类型ESCA患者预后预测的潜在生物标志物.
食管癌、胸苷酸合成酶、生物信息学、预后、免疫浸润
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R735.1(肿瘤学)
国家自然科学基金;河南省医学科技攻关重大项目
2023-08-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
721-728
