不同商品化试剂盒定量检测肝癌晚期患者乙型肝炎病毒DNA结果的差异
目的 探讨不同商品化试剂盒定量检测肝癌晚期患者乙型肝炎病毒(HBV)DNA结果的差异.方法 选择2013年10月2日淄博市传染病医院收治的1例肝癌患者为研究对象.分别使用罗氏诊断产品(上海)有限公司和天隆科技有限公司的HBV DNA定量检测试剂盒对该例肝癌患者血清样本进行不同时间的4次HBV载量检测.取患者3 mL血清进行二代测序,并将肝癌患者基因组中HBV开放阅读框Precore/core区序列与通用参考序列比对,分析差异区域.应用MiSeqRepoter软件对二代测序结果进行分析,寻找患者染色体中嵌合的HBV基因组序列.结果 罗氏诊断产品(上海)有限公司HBV DNA定量试剂盒4次检测结果均为HBV感染阴性,天隆科技有限公司HBV DNA定量试剂盒4次检测HBV载量均>1×104 IU·L-1,均为HBV感染阳性.二代测序结果显示,患者基因组中含有病毒DNA读长509617 bp(1%),509617 bp病毒DNA中498064 bp(98%)为HBV DNA.与通用序列比对结果显示,肝癌患者基因组中HBV Precore/core区序列中未发现突变位点,患者基因组中的HBV Precore/core区中P区1700~2140 bp区间缺失.二代测序结果显示,患者多条染色体上整合了HBV基因组,其中5号染色体上HBV基因组读长3136 bp,1号染色体上HBV基因组读长2274 bp,10号染色体上HBV基因组读长51 bp,6号染色体上HBV基因组读长47 bp.结论 不同商品化HBV DNA定量试剂盒检测结果存在差异,可能是HBV感染时整合到宿主染色体上导致的序列缺失,在使用不同的检测试剂盒进行临床诊断时务必慎重.
乙型肝炎病毒、DNA定量检测、二代测序、肝癌晚期
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R512.6+2;R735.7(传染病)
西安市科技计划项目;西安市中心医院科研基金
2022-12-29(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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