哺乳动物雷帕霉素靶蛋白与结直肠癌关系的生物信息学分析

摘要：

目的 通过研究哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)与结直肠癌的生物信息,意在推动结直肠癌医疗手段进步,实现挽救结直肠癌患者生命的目的.方法 分析2013年5月—2021年5月癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)公共数据库的COAD&READ患者数据698份,其中正常组51例,结肿瘤组647份.分析了TCGA结直肠癌患者的表达谱、mTOR的表达和生存差异,并探讨了mTOR的共表达调控网络.此外,还探讨了mTOR与富集通路、微卫星不稳定性(microsatellite insta-bility,MSI)、肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)的关系.结果 基于GSE73360数据库分析mTOR在组织中的表达差异,mTOR在正常组织中表达(7.0084±0.429089872)低于mTOR在肿瘤组织中表达(8.04058±0.784400233),差异有统计学意义(P＜0.05).共筛选出541个与mTOR表达显著相关的基因.核心基因高低表达在MSI和TMB方面比较,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 mTOR可以作为结直肠癌诊断和预后的生物标志物.

关键词：结直肠癌、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白、生物信息学、信号通路

所属期刊栏目：8

分类号：R735.3(肿瘤学)

资助基金：福建省卫生健康科研人才培养项目;福建省自然科学基金项目;莆田市科技计划项目;莆田学院引进人才科研基金项目

在线出版日期：2023-07-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：33-37