发育性髋关节脱位家系全基因组外显子测序研究

摘要：

目的 对一个三代四人发病的DDH家系进行研究,以期发现与DDH发病相关的致病基因或易感基因.方法 对一个三代四人发病的DDH家系中的3个DDH患者和2个健康成员的血液样本进行全外显子测序并对测序结果进行生物信息学分析.采用Sanger测序验证分析获得的致病候选变异在其他可获得血液样本的家系成员中突变情况.结果 外显子测序结果经过生物信息学分析后发现有2个基因可能与DDH的发病有关:①骨形成蛋白2诱导激酶基因(bone morphogenic proteins-2-inducible kinase gene,BMP2K)中存在的改变蛋白修改功能的多核苷酸缺失/插入突变(c.1432_1440delCAGCAGCAG,p.Gln478_480del或c.1440_1441insCAG,p.Gln480ins),该突变位于第4号染色体第11外显子.②前列腺素F2α受体基因(prostaglandin F2α receptor,PTGFR)中存在的终止密码子突变(c.C922T,p.R308X),该突变位于第1号染色体PTGFR基因的第2/4外显子.DDH患者和具有潜在突变携带可能的正常母亲血液样本中均有BMP2K和PTGFR突变,而作为对照的正常姐姐的血液样本中没有BMP2K和PTGFR突变.Sanger测序验证结果显示,家系中的全部4例DDH患者(100％)和有血缘关系的12例正常家系成员中的3例(25％)存在BMP2K基因的杂合突变和PTGFR的终止密码子突变,而8例无血缘关系的正常家系成员无BMP2K基因和PTGFR基因突变.结论 研究结果提示BMP2K基因的杂合突变和PTGFR的终止密码子突变可能是导致该家系DDH发病的致病基因或易感基因.结合家系的宝贵遗传信息和二代测序的高效、高通量技术是发现与DDH发病相关的致病位点的有效途径.

关键词：髋关节脱位、外显子、序列测定、基因突变、易感基因

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资助基金：国家自然科学基金81401763;上海市卫生计生委科研项目20144Y0176;上海市科学技术委员会科研项目12DZ2295006;上海交通大学医学院“985”计划基金YBKL2013008National Natural Science Foundation of China81401763;Health & Family Planning Committee of Shanghai Science Foundation20144Y0176;Shanghai Science & Technology Committee12DZ2295006;985 Project Fund from Shanghai Jiao Tong University School of MedicineYBKL2013008

在线出版日期：2018-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：171-177