神经母细胞瘤SK-N-SH细胞在氯化钴模拟缺氧后侧群细胞基因表达谱的变化

摘要：

目的 探讨SK-N-SH神经母细胞瘤株在氯化钴模拟缺氧条件下侧群(side population,SP)细胞比例的变化及SP细胞基因表达谱的改变.方法 采用二氯化钴模拟缺氧条件,然后利用Hoechst 33342染料法,通过流式细胞仪紫外激光检测分选功能分选出缺氧及常氧SK-N-SH细胞中的SP细胞,利用Agilent 8×60K人(Human) G3表达谱芯片进行检测,并对基因芯片结果进行分析,以荧光定量PCR验证芯片结果.结果 SK-N-SH细胞株的SP细胞比例约为8.65％,缺氧后降至约2.08％;缺氧SP细胞和常氧SP细胞mRNA及lincRNA的表达谱存在明显差异.差异＞2倍的基因有5077 mRNA、1383 lincRNA、其中上调的有2550 mRNA、572 lincRNA,下调的有2527 mRNA、81 1 lincRNA.差异表达的基因主要涉及细胞周期、DNA复制、p53及MAPK信号通路等生物学过程.荧光定量PCR基因结果与芯片差异基因结果表达趋势一致.结论 缺氧使SP细胞比例下降,并使SP细胞mRNA和lincRNA的表达谱均发生显著改变,提示mRNA和lincRNA共同参与调节神经母细胞瘤SP细胞在缺氧环境中的生物学行为.

关键词：神经母细胞瘤、细胞低氧、RNA、信使

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分类号：R735.2;R394.2;S

资助基金：上海市科委自然基金10ZR1404600

在线出版日期：2014-02-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：922-926